杭州师范学院临床医学院前身是浙江医科大学杭州分校临床医学系，建立于1979年。1993年更名为杭州医学高等专科学校临床医学部，2001年升格为杭州师范学院医学院临床医学系，2004年成立杭州师范学院临床医学院。现任院长为浙江省人大常委、全国五一奖章获得者、博士生导师吴正虎教授。
    学院有学校编制教工93人，医院编制690人，其中教授/主任医师27人，副高以上职称101人。现有临床医学专业（五年制本科），口腔医学专业（三年专科），设有内科、外科、妇科、儿科等19个教研室，哮喘研究所、肾病血液透析研究中心等12个研究所室，及34个临床科室和13个医技科室，并拥有杭州市心血管研究所、杭州市放射免疫检测中心（杭州市重点专科建设项目）。全院现有在校全日制学生1403人，成人教育学生3000余人，是杭州师范学院最大的二级学院之一。
    学院现有一所三级乙等综合性附属医院（杭州市第二人民医院），开设病床500余张，占地面积54000平米，建筑面积50000平米，拥有先进的医疗仪器设备。2005年9月5日，60000平方米的新综合大楼开始动工兴建，该项目建成之后，医院将成为一所现代化、智能化的大型综合性医院。学院同时还有5所非直属附属医院、28所教学医院、15所实习医院。
    根据杭州师范学院“三步走”战略，临床医学院已基本形成本科教学为主、专科教学为辅、积极发展研究生教育、大力发展成人教育和远程教育的高等医学教育格局，力争到2010年把杭州师范学院临床医学院办成适应社会需求、专业特色明显，省内一流、国内有影响的临床医学院。考研共济网http://www.kaoyantj.com