黑龙江中医药大学中医药研究院始建于1994年，前身为黑龙江中医药大学中医药研究部，是由分散于学校的四个研究所整合而成，首任主任为田振坤教授，（现任黑龙江中医药大学附属第一医院院长），在学校党政班子的领导支持下，领导全院科研人员走出了建院初期困境，为中医药研究院的创建和发展做出了杰出的贡献。现任院长为王建明教授，刘树民教授任书记副院长。整合后的研究院有六个研究室分别是中医药基本理论研究室、药物分析研究室、药物制剂研究室、中药化学研究室、药理学与毒理学研究室、中医工程研究室。主要从事中药新药的开发与研制国家新药以及运用现代科技手段研制开发推广名老中医专家诊断诊疗系统。
　　在成立十多年的科研活动中成果显著，中标的课题均已通过国家和省级鉴定并获得多项科技进步奖：国家新药“龙牙肝泰”的研究已获新药证书，并进行科技转化由黑龙江久久药业有限责任公司生产并推向市场。 112室
　　黑龙江中医药大学中医药研究院具有较强的现代科研意识和开拓精神，在完成国家和省计划课题的同时，积极加强横向联合，努力实现科学技术为社会服务的目的，先后为多家企业研制和开发新药十余种，如“排石饮液”、“前列闭尔通”、“中龙肝脾康”、“珍芪降糖胶囊”、“卢痛宁冲剂”、“羚羊降压冲剂”等。在电脑科技时代的今天，运用先进的科技手段，总结研究名老中医专家的经验，研制和开发了中医专家诊疗系统，把中医独特的学术思想和宝贵的临床经验用计算机模拟继承下来，使他们的经验流芳百世造福人类，在社会上取得了良好的影响，其中男性病诊疗系统已通过省级签定。 共
     目前，中医药研究院全体同仁正以积极的态势，饱满的工作热情振奋精神，与时俱进，认真学习贯彻落实党的十六大精神，以“三个代表”的重要思想为指针，积极投入到科学研究事业中，同时欢迎具有严谨科学意识并与之作为一生事业追求的年轻同事加盟，共创中医药科学领域的美好明天。